Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrx2Q06348 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms