Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms