Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk18Q04899 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms