Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CkbQ04447 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms