Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scg2Q03517 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scg2Q03517 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms