Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Crisp3Q03402 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms