Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msx2Q03358 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msx2Q03358 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms