Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aplp1Q03157 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aplp1Q03157 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms