Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NfiaQ02780 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NfiaQ02780 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms