Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cacna1cQ01815 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms