Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms