Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VldlrP98156 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VldlrP98156 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VldlrP98156 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms