Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shc1P98083 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms