Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn1bP97952 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms