Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VegfdP97946 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms