Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smn1P97801 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smn1P97801 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smn1P97801 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smn1P97801 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smn1P97801 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smn1P97801 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smn1P97801 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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