Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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