Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pitx2P97474 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pitx2P97474 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms