Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms