Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nbr1P97432 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nbr1P97432 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms