Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Frg1P97376 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frg1P97376 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frg1P97376 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms