Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vgll3P85442 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms