Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgcdP82347 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgcdP82347 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms