Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms