Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx2P81066 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms