Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms