Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tp53bp1P70399 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms