Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rad50P70388 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad50P70388 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms