Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chl1P70232 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chl1P70232 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms