Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd13P70217 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms