Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Traf6P70196 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf6P70196 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms