Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps17P63276 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps17P63276 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms