Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps27aP62983 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms