Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2bP62915 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2bP62915 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms