Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3P62908 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rps3P62908 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms