Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps28P62858 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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