Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3cP62823 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3cP62823 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3cP62823 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3cP62823 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3cP62823 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3cP62823 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3cP62823 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3cP62823 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3cP62823 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3cP62823 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3cP62823 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3cP62823 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3cP62823 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms