Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snrpd3P62320 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms