Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms