Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ufm1P61961 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms