Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smg6P61406 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg6P61406 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smg6P61406 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg6P61406 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms