Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme3P61290 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme3P61290 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms