Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PlnP61014 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PlnP61014 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PlnP61014 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PlnP61014 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PlnP61014 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PlnP61014 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PlnP61014 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PlnP61014 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PlnP61014 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PlnP61014 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms