Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ActbP60710 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ActbP60710 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ActbP60710 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ActbP60710 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ActbP60710 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ActbP60710 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ActbP60710 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ActbP60710 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ActbP60710 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms