Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif3eP60229 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3eP60229 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3eP60229 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3eP60229 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3eP60229 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3eP60229 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3eP60229 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eif3eP60229 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eif3eP60229 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms