Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup43P59235 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup43P59235 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms