Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Senp1P59110 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Senp1P59110 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms