Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps33bP59016 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps33bP59016 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms