Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Paxbp1P58501 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Paxbp1P58501 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms