Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Strn4P58404 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Strn4P58404 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strn4P58404 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms